En 2012-2013, la FOMC a réalisé un examen de sa gouvernance, menant à la création d’un nouveau conseil de travail composé des 13 registraires des ordres des médecins provinciaux et territoriaux, qui s’est réuni pour la première fois en février 2014. Durant cette période, la FOMC a traité plusieurs enjeux clés, notamment les nouveaux règlements fédéraux sur le cannabis médical, l’aide médicale à mourir, l’amélioration de la pratique, la santé des médecins, la prescription de substances contrôlées, ainsi que le développement d’un système intégré de gestion des risques pour les régulateurs.